医保结算单电子版的查询方法如下：
1、在手机中打开支付宝，点击首页的“更多”进入更多应用；
2、点击便民生活中的“城市服务”，进入城市服务页面；
3、将城市定位为自己的所在地，点击“医保电子凭证”；
4、点击“同意协议并激活”，授权激活后领取“医保电子凭证”，在“卡包-证件”中查看；
5、需要使用时，进入卡包，找到“医保电子凭证”，点击立即使用即可。
医保的报销流程：
1、患者持医保卡到定点医疗机构就诊；
2、医疗机构根据患者情况开具诊疗方案，并进行医保结算；
3、患者支付个人承担部分费用后，医疗机构将费用信息上传至医保中心；
4、医保中心审核费用信息，确定报销金额并划拨至医疗机构；
5、医疗机构收到医保中心划拨的报销金额后，完成整个报销流程。
综上所述，查询医保结算单电子版可通过支付宝操作，首先进入“更多应用”选择“城市服务”，定位城市后点击“医保电子凭证”，同意协议并激活领取后，在“卡包-证件”中查看，使用时在卡包中找到并点击立即使用，流程简便快捷。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
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