农村自建房由当地的规划建设局审批。
一、农村自建房审批办理程序：
1、建房户向村委会提出建房申请。
2、村委会审核同意，签字盖章
3、向乡乡建办提出申请。
4、乡建办工作人员实地踏看，同意建房。
5、到乡乡建办领取房屋建设申请表。
6、经乡建办签字同意。
7、乡主管领导签字盖章，核实同意。
8、交县规划建设局审批（县行政服务中心）。
9、建房户领取产权证。
二、农村建房需要注意的问题
1、 自建房要选择好的建造团队，要有建筑草图。
2、自建房要监工保障，保证建房质量，要准备钢材，砖瓦，水泥等材料。
3、自建房要建房涉及到占用公共道路的问题，要处理好邻里关系。要写一张建筑合同，这样在结算的时候才能有据可谈，避免结算出现问题。
4、自建房要设计好地下管道到问题，一劳永逸，要不然麻烦大了。
5、自建房要不要忘了线路铺设。要保证墙体垂直。
6、自建房要准备门窗，好预留门窗大小。
7、自建房如果是楼房建设要注意给邻居的遮荫问题，处理好自己楼房的面积和结构合理。
8、自建房要准备动力电源。
9、自建房要选择好建房季节，最好是正月过后就建。
10、自建房地基一定要处理好。
三、农村村民每户只能有一处宅基地，农村村民申请宅基地必须符合下列情况之一：
1、现在住房影响乡（镇）村建设规划，需要搬迁重建的；
2、农村村民户除身边留一子女外，其他子女确需另立门户而已有的宅基地低于分户标准的；
3、经主管部门批准，由外地迁入的农户无住房的；
4、集体组织招聘的技术人员要求在当地落户且户口已迁入的；
5、离休、退休、退职的干部职工，复退军人和华侨、侨眷、港澳台同胞持合法证明回原籍定居，需要建房而又无宅基地的。
法律依据：
《村庄和集镇规划建设管理条例》第十三条
村庄、集镇建设规划，应当在村庄、集镇总体规划指导下，具体安排村庄、集镇的各项建设。
集镇建设规划的主要内容包括：
住宅、乡（镇）村企业、乡（镇）村公共设施、公益事业等各项建设的用地布局、用地规模，有关的技术经济指标，近期建设工程以及重点地段建设具体安排。
村庄建设规划的主要内容，可以根据本地区经济发展水平，参照集镇建设规划的编制内容，主要对住宅和供水、供电、道路、绿化、环境卫生以及生产配套设施作出具体安排。