法律分析：在申请职务犯罪案件的赔偿时，需要提供充分的证据证明自己的损失及其与被告人的职务犯罪行为之间的因果关系。具体需要存放哪些证据，主要根据侵权行为的性质、起因及造成的后果而定，一般包括以下几种证据：
1. 侵权事实证据：如被告人的职务犯罪证据、涉及的证据材料、证人证言等。
2. 损失证据：包括医疗费用、康复费用、交通费用、营养费用、护理费用、住宿费用、误工费用、精神损失抚慰金等。
3. 因果关系证据：需要证明自己的损失与被告人的职务犯罪行为之间存在因果关系，一般可以通过医生证明、鉴定意见、证人证言等方式来证明。
法律依据：
《中华人民共和国侵权责任法》第二十二条：“因犯罪行为造成损害的，受害人有权依法向犯罪分子追偿。受害人向犯罪分子追偿的权利不受其他法律。”
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零二条：“当事人对所涉及的事实有证据负担的，应当提供证据。”
《最高人民关于审理职务犯罪民事赔偿案件适用法律若干问题的解释》第七条：“职务犯罪民事赔偿案件中，要求原告提供证据的，包括侵权事实证据、损失证据和因果关系证据。”