商标权侵权引起的纠纷解决如下：
1、当事人协商解决，商标注册人或者利害关系人向提起诉讼，或者请求有关行政主管部门处理。工商行政管理部门有权认定侵权行为，并采取执法措施责令停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和专门用于制造侵权商品、伪造注册商标的工具，可以处以罚款；
2、当事人不服责令停止侵权的行政处理决定，可以依法提起行政诉讼；侵权人期满不起诉、不履行的，工商行政管理部门可以申请人民强制执行。通过行政机关解决商标权侵权纠纷的程序相对简单，从制止侵权的目的来看也是有效的，但被侵权人不能通过这种行政调查获得民事赔偿。行政部门只能在调查过程中调解民事赔偿问题。双方不能达成协议，被侵权人仍想获得民事赔偿的，只能向人民提起诉讼；
3、被侵权人也可以直接向人民提起侵权诉讼，诉讼是最终的解决办法。即使是工商行政管理机关处理的案件，当事人不服的，仍可以向人民起诉，通过司法渠道提出各种民事救济请求。
一、淘宝店铺商标侵权怎么处罚
1、淘宝店铺商标侵权的，工商管理部门可以对侵权人进行处罚，责令立即停止侵权行为；
2、没收、销毁侵权商品，并且处以罚款。
3、法律规定：《中华人民共和国商标法》
第六十条有本法第五十七条所列侵犯注册商标专用权行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。
工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。对五年内实施两次以上商标侵权行为或者有其他严重情节的，应当从重处罚。销售不知道是侵犯注册商标专用权的商品，能证明该商品是自己合法取得并说明提供者的，由工商行政管理部门责令停止销售。
对侵犯商标专用权的赔偿数额的争议，当事人可以请求进行处理的工商行政管理部门调解，也可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民起诉。经工商行政管理部门调解，当事人未达成协议或者调解书生效后不履行的，当事人可以依照《中华人民共和国民事诉讼法》向人民起诉。