涉外合同协议的管辖的认定是：如果当事人在合同中订有仲裁条款或者事后达成书面仲裁协议的，则由中华人民共和国涉外仲裁机构或者其他仲裁机构管辖，不得管辖；如果没有上述仲裁条款或协议的，则由具有管辖权的管辖。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民事诉讼法》第二百七十
涉外经济贸易、运输和海事中发生的纠纷，当事人在合同中订有仲裁条款或者事后达成书面仲裁协议，提交中华人民共和国涉外仲裁机构或者其他仲裁机构仲裁的，当事人不得向人民起诉。当事人在合同中没有订有仲裁条款或者事后没有达成书面仲裁协议的，可以向人民起诉。