发生土地确权纠纷的，当事人可以找土地管理行政部门解决，或是请有关组织调解，也可以向仲裁机构申请仲裁，或是直接向起诉。
一、商铺出租纠纷如何处理？
商铺出租转让发生纠纷的，合同当事人应当协商处理，协商不成的，可以向起诉或者到仲裁机构申请仲裁，当事人愿意调解的，可以优先调解。
根据《民事诉讼法》第三条规定，人民受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。
第九十三条规定，人民审理民事案件，应根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
《仲裁法》第二条规定，平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
二、私自占用耕地违法吗
违法。因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡（镇）等调解解决。当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民起诉。
三、有什么解决买卖合同争议的方法
1、在友好的基础上，合同当事人通过相互协商解决纠纷是最好的方式；
2、合同当事人不能协商一致的，可以要求有关机构调解。一方或者双方为国有企业的，可以要求上级机关调解。上级机关应当在平等的基础上分清是非调解，不得进行行政干预。当事人还可以要求合同管理机关、仲裁机构、等进行调解；
3、合同当事人协商不成、不愿调解的，可以根据合同规定的仲裁条款或者双方在纠纷发生后达成的仲裁协议，向仲裁机构申请仲裁；
4、合同中未订立仲裁条款，事后未达成仲裁协议的，合同当事人可以向起诉合同纠纷，寻求司法解决。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国土地管理法》
第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由处理。
单位之间的争议，由县级以上处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级或者县级以上处理。
当事人对有关的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。