个人所得税每年退税的主要原因如下：
1、上一年度综合所得年收入额不足6万元，但平时预缴过个人所得税的；
2、上一年度有符合享受条件的专项附加扣除，但预缴税款时没有申报扣除的。
3、 因年中就业、退职或者部分月份没有收入等原因，减除费用6万元、“三险一金”等专项扣除、子女教育等专项附加扣除、企业（职业）年金以及商业健康保险、税收递延型养老保险等扣除不充分的；
4、没有任职受雇单位，仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，需要通过年度汇算税前扣除的；
5.、纳税人取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，年度中间适用的预扣率高于全年综合所得年适用税率的；
6.、预缴税款时，未申报享受或者未足额享受综合所得税收优惠的，如残疾人减征个人所得税优惠等；
7、有符合条件的公益慈善事业捐赠支出，但预缴税款时未办理扣除的等等。
个人所得税退税流程是怎样的：
1、首要条件就是年度你已经纳过税，且应纳税额已经预收预缴的税款金额；
2、下个人所得税APP，注册账号，登陆账号。个人所得税APP非常智能，注册好之后，在个人中心完善个人信息，并添加银行卡，这张银行卡就是税款将要退回的地方；
3、查询年度的纳税明细。可以在首页的“收入纳税明细查询”一栏中查询，里面有年度和每个月的的收入金额和已申报税额；
4、在办税界面-税费申报-综合所得汇算申报处进行申报。默认的是简易申报，系统已经自动计算出退税金额。如果需要调整申报数额，可以切换到“标准申报”进行办理。确认提交后就可以申请退税啦；
5、等待。在服务界面-申报信息查询中，点击申报查询可以查看退税的进度。
综上所述，个人所得税退税是因为公司每个月在做个人所得税扣税的时候，可能会因为错用税率，导致交税错误，所有会出现有些人是需要退税的，有些人是需要补税的。个人所得税退税，也就是财务上说的个人清缴汇算，每年都会做。
【法律依据】：
《个人所得税代扣代缴暂行办法》第四条
扣缴义务人向个人支付下列所得，应代扣代缴个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）对企事业单位的承包经营、承租经营所得；
（三）劳务报酬所得；
（四）稿酬所得；
（五）特许权使用费所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得；
（十）经财政部门确定征税的其他所得。
第五条
扣缴义务人向个人支付应纳税所得（包括现金、实物和有价证券）时，不论纳税人是否属于本单位人员，均应代扣代缴其应纳的个人所得税税款。
前款所说支付，包括现金支付、汇拨支付、转帐支付和以有价证券、实物以及其他形式的支付。
第六条
扣缴义务人应指定支付应纳税所得的财务会计部门或其他有关部门的人员为办税人员，由办税人员具体办理个人所得税的代扣代缴工作。
代扣代缴义务人的有关领导要对代扣代缴工作提供便利，支持办税人员履行义务；确定办税人员或办税人员发生变动时，应将名单及时报告主管税务机关。