企业合并后的债务由存续的公司承继。公司合并需要由股东大会经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过，之后签订合并协议，通知公告债权人，编制资产负债表以及财产清单。根据相关法律规定，被合并的公司应当申请注销登记，此时不需要进行清算。
一、企业兼并流程是什么呢
企业兼并流程如下：
1、公司召开股东大会表决公司合并；
2、公司股东大会通过合并决议的；
3、审计和资产评估；
4、签订合并协议；
5、通知债权人并公告。
根据相关法律的规定，公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
二、分公司合并怎么办？
分公司合并应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当通知债权人，并于报纸上公告。债权人可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。
三、公司合并后员工该怎么处理
公司合并后员工由存续的公司或者新设的公司接收，继续履行原劳动合同。
公司与员工自用工之日起建立劳动关系，订立书面劳动合同。公司发生合并或者分立等情况的，不影响合同的效力。
公司合并流程为：
1、通过股东会决议，与合并方订立书面的合并协议；
2、编制资产负债表及财产清单；
3、通知债权人并进行公告；
4、办理公司的合并登记。
债务的处理是由合并后的公司承担。公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。
【本文关联的相关法律依据】
《公司法》第一百七十二条
公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。
一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
第一百七十三条
公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。