沉香如屑帝尊是在后期被杀的。 剧本上写的剧情是，后面帝尊结局悲惨，主要是因为在应渊率领兵征战重伤归来之后，那心机叵测的恒钦就趁此机会神不知鬼不觉地杀了帝尊，并运用法术幻化成帝尊的模样。
帝尊被桓钦暗中害死，他用幻术变成了帝尊的样子，给天界带来了劫难。