处理合同纠纷的方法有双方应本着相互理解、相互让步的精神，通过协商解决争议。这种解决纠纷的方式，不需要任何第三方的介入，有利于及时解决纠纷和双方的团结，有利于保持企业之间长期建立的合作关系。因此纠纷发生后，当事人应以协商作为解决纠纷的首选。第三人调解。在合同中发生纠纷时，当事人可以要求在协议条款中约定的单位或人员在中间调解。这种调解不同于仲裁程序和诉讼程序。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》依法成立的合同，自成立时生效。法律、行规规定应当办理批准、登记等手续生效的，依照其规定。对于需要办理批准登记手续的，要及时办理相应法律手续。 民事行为能力人订立的合同，经法定代理人追认后，该合同有效，但纯获利益的合同或者与其年龄、智力、精神健康状况相适应而订立的合同，不必经法定代理人追认。相对人可以催告法定代理人在一个月内予以追认。法定代理人未作表示的，视为拒绝追认。合同被追认之前，善意相对人有撤销的权利。撤销应当以通知的方式作出。