注销食品经营许可证的，应当由当事人携带相关材料前往当地工商管理部门进行申请，在审核通过之后即可以注销该许可。我国《食品经营许可管理办法》规定，食品经营者未按规定申请办理注销手续的，原发证的食品药品监督管理部门应当依法办理食品经营许可注销手续。
《食品经营许可管理办法》第二条 在中华人民共和国境内，从事食品销售和餐饮服务活动，应当依法取得食品经营许可。食品经营许可的申请、受理、审查、决定及其监督检查，适用本办法。 《食品经营许可管理办法》第三十六条 食品经营者终止食品经营，食品经营许可被撤回、撤销或者食品经营许可证被吊销的，应当在30个工作日内向原发证的食品药品监督管理部门申请办理注销手续。